Это строение поистине уникально, пережило множество событий в своей истории, меняло форму, название, обличье и предназначение. Расположившись между торговыми куполами и прудом, впоследствии ставшем ансамблем Ляби-Хауз, была, видимо, изначально какая-то притягательность в этом месте, никогда не обделяемом человеческим вниманием.

Неизвестно доподлинно, чему предназначались эти места в начале времен, но хроники повествуют, что еще до арабского завоевания здесь располагался базар с бойкой торговлей пряностями, травами и лекарственными снадобьями.

На самой же территории мечети «Маггоки Аттори» ранее располагалось культовое заведение язычников — зороастрийский «Храм Луны».

Как повествует в одном из своих поздних трудов историк Наршахи, мечеть уже в 10 веке носила название «магок», что дословно переводится как «в яме», что обусловлено ее расположением – на глубине 4,5 метров в связи с приростом культурных пластов.

Раскопки, проведенные в 40-х годах 20 века ученым В.Шишкиным  позволили полностью удалить почти тысячелетние наросты культурного слоя, вернув ей аутентичный вид. Их результаты показали, что первое здание мечети на четырех столпах было возведено здесь еще в 9 веке. Ее фасад украшали резьба и роспись.

В 12 веке мечеть ждала очередная перестройка, с сохранением основного плана, однако ввиду окруживших ее пластов пришлось несколько отступить от традиций и поместить вход с юга. До наших дней от оригинальной постройки уцелел лишь портал, верхняя его часть была полностью утрачена. Вплоть до 16 века она считалась квартальной.

Тот вид, в котором Магоки Аттори предстает перед нами ныне, она обрела уже во время реконструкции 16 века, надпись о которой запечатлена на сводах нового портала. Несмотря на монохромность, она интересна своим резным декором – ее витиеватые мельчайшие детали, и «кружевные» узоры выполненные резьбой по алебастру, мозаикой, майоликой и терракотой можно зачарованно рассматривать часами.

Бытует мнение, что именно «Подземная мечеть» была молельным местом, как для мусульман, так и для евреев до времени постройки первой синагоги. Существует несколько мнений о том, как это осуществлялось практически – по одной из версии молитвы осуществлялись в разных углах, по другой – службы евреев начинались по окончании мусульманских молитв. Предполагается, что именно от тех событий и идет обычай завершающей молитву фразы «Шалом Алейхем – Мир Вам», употребляемой только бухарскими евреями.

Если Бухару и ее старый город рекомендуют путешественникам, желающим увидеть подлинную восточную старину, то Магоки Аттори – это подлинная жемчужина древности, явившаяся на свет еще в домусульманский период, намоленное место и уникальный памятник истории, чудом уцелевший и дошедший до наших дней, буквально обретя свое второе рождение из многовековых оков земли.